Индекс, одна из ключевых фигур в Академия-Сити, продолжает находиться под пристальным вниманием влиятельных магических организаций. Эти группы стремятся использовать 103 тысячи запрещенных гримуаров, хранящихся в ее памяти, для достижения собственных целей. Ситуация обострена тем, что данные знания представляют угрозу для церковных структур, что делает Индекс объектом постоянных преследований. В сложившихся обстоятельствах Индекс полагается на поддержку своего друга Томы Камидзё. Он вместе с

Акуто Сай, воспитанник церковного приюта, поступает в Академию магии «Константа». Его личные цели связаны с установлением мира и получением поста первосвященника. Однако оракул, предсказывающий будущее учащихся, определяет для него иной путь: согласно пророчеству, Сай станет князем тьмы. Сам герой не принимает такое развитие событий, но оракул демонстрирует точность в своих предсказаниях. Титул князя тьмы привлекает к Саю внимание нескольких девушек, включая одноклассниц и андроидов, чьи

В аду произошла революция, в результате которой новые демоны свергли старый порядок. Восстание поддержали Небеса, и шесть богинь пожертвовали собой, чтобы запечатать побежденных. Однако часть демонов не смирилась с новым положением. Печать, сдерживающая поверженных, была сорвана, и шестьдесят тысяч демонов вырвались на свободу. Лишенные власти, они укрываются в сердцах людей и питаются их отрицательными эмоциями, накапливая силы для мести демонам, занявшим их место. Для борьбы со сбежавшими

Фуюки, город, расположенный между океаном и горами, служит местом проведения древнего ритуала. Участники сражаются за Святой Грааль, артефакт, который, по преданиям, может исполнить любое желание владельца. В конфликте задействованы семь магов, каждый из которых заключает договор с одним из семи героических духов: Сэйбер, Лансер, Арчер, Райдер, Кастер, Ассассин и Берсеркер. Маги со своими слугами вступают в бои, которые продолжаются до тех пор, пока не останется единственная пара победителей.

Такатоси Цуда поступает в академию Осай после перехода в старшую школу. Учебное заведение год назад было женской школой, и текущий год стал первым с совместным обучением. Главный герой выбирает академию из-за близости к дому, не придавая значения этому факту. В первый день Такатоси сталкивается с тем, что вокруг него находятся только девушки. По пути в школу и внутри академии он оказывается в окружении учениц. Позже он встречает президента ученического совета Сино Амакусу, которая предлагает