Сюжет разворачивается в вымышленном городе Йокогама, где существуют артефакты, называемые Игрушками. Эти предметы наделяют владельцев сверхспособностями. Четыре ученицы Академии Холмса - Шерли Шеллингфорд, Ниро Юдзурисаки, Эркюль Бартон и Корделия Глаука - используют свои силы для раскрытия преступлений. Шерли владеет телекинезом, Ниро управляет механизмами, Элли обладает физической силой, а Корделия может усиливать органы чувств. Вместе они образуют команду под названием «Милки Холмс» и
Фу Саватари выросла в семье, где фотография занимала важное место благодаря отцу. После его смерти старый фотоаппарат стал для неё памятью о родителе. Прошло пять лет, и Фу вместе с семьей переезжает в Такахэру, родной город отца, где она провела детство. В этом городе она ранее подружилась с Каору Ханавой, и их общение продолжилось в старшей школе. Когда Фу и Каору забирали камеру из ремонта, они случайно встретили Нориэ Окадзаки и Маон Сакураду. Эта встреча положила начало новым знакомствам.
Комаки Манака, старшеклассница, испытывает романтический интерес к своему однокласснику Коно Такааки, но не решается начать с ним разговор. Ситуация меняется, когда Такааки помогает ей в библиотеке. В результате они договариваются о регулярных совместных занятиях в этом месте и решают обращаться друг к другу по именам, что для японской школьной среды является признаком близких отношений. Однажды разговор Манаки и Такааки за пределами библиотеки случайно слышит его приятель Косака Юдзи. Он
Моритака Маширо в детстве хотел стать мангакой, как его дядя Таро Кавагути, создатель популярной комедийной манги. После трагического события он отказался от этой мечты и сосредоточился на учебе в средней школе, планируя стать офисным работником. Однажды его одноклассник Акито Такаги, лучший ученик школы и начинающий писатель, замечает детальные рисунки в тетради Моритаки. Такаги видит потенциал в его художественном таланте и предлагает вместе создавать мангу. После долгих уговоров Моритака
На остров Южного Креста, расположенный к югу от Японии, ночью выносит юношу по имени Такуто Цунаси. Он прибыл из Японии в одиночку, без вещей, и поступает в Старшую Школу Южного Креста. Такуто быстро находит общий язык с одноклассниками, среди которых Вако Агэмаки и Сугата Синдо. Школа скрывает секрет: в её подземельях находятся два десятка спящих меха-устройств, называемых «Кибоди». Управлять ими могут только обычные люди, но лишь в параллельном измерении Нулевое Время. Вскоре Такуто
Индекс, одна из ключевых фигур в Академия-Сити, продолжает находиться под пристальным вниманием влиятельных магических организаций. Эти группы стремятся использовать 103 тысячи запрещенных гримуаров, хранящихся в ее памяти, для достижения собственных целей. Ситуация обострена тем, что данные знания представляют угрозу для церковных структур, что делает Индекс объектом постоянных преследований. В сложившихся обстоятельствах Индекс полагается на поддержку своего друга Томы Камидзё. Он вместе с
