Низкоквалифицированный ниндзя

После Второй мировой войны в Японии было создано агентство, предназначенное для борьбы с терроризмом и экстремизмом в Тихоокеанском регионе. Для выполнения этой задачи требовались специалисты высокого уровня, и в организацию были набраны ниндзя. Первоначально агентство действовало только в пределах страны, но со временем его зона ответственности расширилась до международного масштаба, а численность сотрудников достигла двадцати тысяч человек.

Одним из сотрудников агентства является семнадцатилетний Куро Кумогакурэ, который совмещает работу с учебой в старшей школе. Он устроился в организацию на полставки, поэтому его деятельность связана с решением повседневных задач, включая школьные обязанности и бытовые вопросы. Сюжет сосредоточен на том, как Куро адаптируется к двойной роли ученика и ниндзя, сталкиваясь с требованиями обеих сфер.