Инспектор Рёко Якусидзи - сотрудница полиции, обладающая высоким социальным статусом и независимым характером. Она не испытывает затруднений в достижении поставленных задач, независимо от возникающих препятствий. Её помощник, лейтенант Дзюнъитиро Идзумида, оказывает ей поддержку в решении служебных вопросов. В Токио происходит серия преступлений, которые не поддаются стандартным методам расследования. Эти события вызывают затруднения у всего полицейского управления, так как их природа остаётся

После завершения трёхстороннего конфликта между энергетической корпорацией «Шинра», повстанческой группировкой «Авалёнч» и военным лидером Сефиротом, планета постепенно восстанавливается. На окраинах разрушенного города Мидгар возникает небольшое поселение Эдж. Рив Туэсти, ранее занимавший пост главы отдела городского развития «Шинры», проводит собеседование с юношей по имени Дензел, который хочет вступить в Всемирную организацию возрождения. Эта организация занимается восстановлением

Действие происходит в недалеком будущем. Вирус под названием «Медуза» распространился по всему миру и вызывает превращение людей в камень. Группа инфицированных, включая 160 отобранных лиц, была помещена в криогенный сон в Центре Гибернации, расположенном в старинном замке. Среди них - Касуми Ишики, которая надеется на будущее излечение и воссоединение со своей сестрой-близнецом Шизуку, также зараженной вирусом. После пробуждения группа обнаруживает, что замок покрыт терниями, а его состояние

22 ноября 2010 года по Японии был нанесен ракетный удар: выпущено 10 ракет, жертв не оказалось. Инцидент назвали «Беспечным понедельником», но из-за отсутствия пострадавших и виновных о нем быстро забыли. Спустя три месяца Саки Морими путешествует по США. Добравшись до Белого дома, она встречает странного молодого человека, стоящего голым посреди трассы и не помнящего о себе ничего. В одной руке он держит пистолет, в другой - телефон. Выглядит он не угрожающе, и Саки отдает ему свое пальто.