Рождение Китаро: Тайна Щелкунчика

События происходят в Японии в 1956 году. Сотрудник банка крови Мидзуки приезжает в деревню Нагура под предлогом участия в трауре по умершему главе клана Рюга. Его фактическая цель связана с личными мотивами, которые он не раскрывает. Параллельно в деревню прибывает седовласый мужчина, разыскивающий свою пропавшую жену. Вскоре в местном святилище обнаруживают тело одного из членов клана, убитого при невыясненных обстоятельствах. Это событие запускает серию последующих происшествий, включающих элементы сверхъестественного.

Два приезжих оказываются втянутыми в конфликт, связанный с внутренними делами клана Рюга и древними силами, которые клан скрывает. Им приходится взаимодействовать друг с другом, чтобы выяснить обстоятельства убийства и найти пропавшую женщину. Фильм представляет собой полнометражную анимационную ленту, созданную к столетию со дня рождения Сигэру Мидзуки. Картина раскрывает предысторию отца Китаро и выступает приквелом к аниме-сериалу 2018 года.