Записная книжка Бога

Наруми Фудзисима — школьник, который держится обособленно от одноклассников из-за частых переездов и нежелания заводить знакомства. После очередного переезда он встречает Аяку Синодзаки, активную и импульсивную одноклассницу. Она убеждает его вступить в кружок садоводства и приглашает отметить это событие на своём рабочем месте. Там Наруми знакомится с Алисой, девочкой примерно 10-12 лет, которая почти не покидает кровать. Она окружена плюшевыми игрушками и мониторами, через которые занимается решением различных загадок и проблем в городе.

Знакомство с Алисой становится отправной точкой для развития сюжета. Её деятельность связана с расследованием происшествий и поиском ответов на вопросы, выходящих за пределы обычной жизни. Наруми постепенно втягивается в её дела, сталкиваясь с ситуациями, которые требуют логического анализа и внимания к деталям. Взаимодействие между персонажами строится на их различиях: пассивность Наруми противопоставляется энергичности Аяки и сосредоточенности Алисы. Основная интрига заключается в раскрытии тайн, которыми занимается Алиса, и в том, как участие в этих расследованиях повлияет на самого Наруми.